Fondata nel 1886 come successore del Missouri, Iowa e Nebraska RR (con licenza nel Missouri nel 1857 e Iowa nel 1866), la cui linea principale di 148 miglia da Keokuk a Van Wert, Ia. è stata acquisita nell’asta fallimentare. Con i suoi oltre 500 carri merci, la ferrovia gestiva principalmente il traffico merci, principalmente carbone e bestiame. Nel 1895 anche acquisizione di Des Moines e Kansas City Ry., il cui tratto di 112 miglia da Des Moines, Ia. a Cainsville, Mo. è stato diviso in 71 miglia a scartamento normale e 41 miglia a scartamento ridotto. Insieme alla Humeston & Shenandoah RR, la pista sarebbe il collegamento perfetto per Jay Gould tra la sua Wabash RR e la sua Union Pacific Ry., ma Chicago, Burlington e Quincy erano di ostacolo, la cui linea principale correva completamente parallela a questo percorso. Con lei, Gould alla fine dovette concordare una joint venture 50:50. Solo dopo il fallimento di Wabash nel 1889, C.B. & Q. poi acquisisce completamente Keokuk & Western e Humeston & Shenandoah nel 1901. Le ultime parti del percorso furono chiuse dall’ultimo proprietario, Burlington Northern, nel 1982.