Fondata nel 1863 a Elberfeld e Barmen, AG dal 1881, trasferimento a Leverkusen nel 1912. Già nel 1904 esisteva un gruppo di interesse con partecipazione agli utili tra le più importanti fabbriche di vernici tedesche dell’epoca, che fu notevolmente ampliato nel 1916 (i contratti corrispondenti a quel tempo avevano una durata fino al 1999). Nel 1925 le grandi aziende chimiche si fusero per formare I.G. Farbenindustrie AG, per cui, su base pro forma, BASF con il successivo cambio di nome era la società per azioni ricevente. Nell’anno della fusione, gli stabilimenti Bayer si estendevano su 430 ettari e impiegavano oltre 8.000 persone. Nel 1951 dopo I.G. Farben ristabilimento da parte degli Alleati della fabbrica di vernici Bayer AG. Nel 1961 l’azienda contava più di 80.000 dipendenti. Nel 1972 cambio del nome in Bayer AG. A partire dal 2002, le quattro divisioni aziendali Crop Protection, Pharmaceuticals, Polymers and Chemicals sono state rese indipendenti sotto l’egida di Bayer AG. Alla fine del 2003, Bayer Chemicals e gran parte del business dei polimeri sono state separate dal gruppo Bayer e quotate in borsa come Lanxess AG. Nel 2006 acquisizione finale di Schering AG, Berlino. Nel 2014 Spin-off e IPO della divisione MaterialScience come Covestro AG. La più grande acquisizione nella storia dell’azienda è avvenuta nel 2018 con l’acquisizione del gruppo statunitense di prodotti agrochimici Monsanto per $ 66 miliardi.